Cabaran dalam Flow Rush ialah kawalan orang ramai. Orang kecil akan memulakan larian mereka dari awal di setiap peringkat. Lebih-lebih lagi, mereka boleh berlari sama ada dalam satu kumpulan berwarna tunggal atau dalam dua kumpulan berbeza warna yang berbeza. Semasa anda menghampiri pintu pagar, bertindak balas dengan cepat terhadap nilai yang tertera padanya dan arahkan orang ramai ke tempat ia boleh berkembang dan bukannya mengecut. Di garisan penamat anda perlu memecahkan halangan dan jika orang ramai sedikit, anda tidak akan dapat melengkapkan tahap dalam Flow Rush. Reaksi cepat akan menyelamatkan anda.
