Seorang ninja menumpukan beberapa jam setiap hari untuk latihan, dan ini perlu supaya tidak kehilangan bentuk dan tidak kehilangan muka pada saat kritikal. Wira permainan Jungle Runner adalah seorang pahlawan yang mahir dan berpengalaman, tetapi latihannya tidak lagi memuaskannya, ia datang terlalu mudah kepadanya, yang bermaksud dia tidak berkembang. Oleh itu, wira memutuskan untuk pergi ke dalam hutan dan melakukan larian menegak melalui pokok. Wira akan tergesa-gesa ke atas dengan kelajuan yang menakjubkan, dan tugas anda adalah untuk memastikan bahawa dia tidak berlanggar dengan apa-apa atau sesiapa sahaja. Ternyata ninja kita tidak keseorangan di dalam hutan, tambahan pula, lebah mutan dalam Jungle Runner akan cuba menghalangnya.