Dua pelari akan memasuki trek dalam permainan Magic Run 3D dan anda akan mengawal salah seorang daripada mereka untuk membantu dia menang, dan anda melepasi tahap. Wira anda akan melalui tahap pertama sahaja, kerana anda perlu selesa dan memahami cara bertindak dan apa yang perlu digunakan. Apabila menghampiri halangan seterusnya, klik pada wira supaya dia berubah secara ajaib dan mudah melepasinya. Dalam satu kes, dia memerlukan kekuatan, dan dalam ketangkasan yang lain. Untuk memanjat tembok tinggi atau berlari terbalik. Selepas melepasi tahap latihan, anda akan bersedia untuk pertandingan dan kemudian tidak menguap dalam Magic Run 3D.