Dalam permainan Batman Bubble Shoot anda akan bertemu bukan hanya Batman sendiri pada masa yang berlainan dalam hidupnya, tetapi juga lawannya, dan khususnya yang paling terkenal - Joker. Sebilangan besar watak dari cerita mengenai pahlawan super akan sesuai di padang permainan, muncul di hadapan anda dalam bentuk gelembung dengan gambar di dalamnya. Sebenarnya, ini adalah penembak gelembung biasa di mana anda harus menjatuhkan semua bola dari lapangan, menembak mereka dari bawah dengan meriam atau hanya mengarahkan bola yang muncul ke saluran yang diinginkan. Dengan mengumpulkan tiga atau lebih bola, anda akan memprovokasi mereka jatuh. Sekiranya bola mencapai garis putus-putus putih bawah, permainan Batman Bubble Shoot akan berakhir.