Spider-Man mengalami perkara-perkara luar biasa yang kadang-kadang berlaku, terutama akhir-akhir ini. Dia boleh tidur di rumahnya, dan bangun di tempat yang sama sekali berbeza. Ini adalah sejenis teknologi sihir atau super, yang perlu anda ketahui sebelum ia menjadi lebih teruk. Dalam permainan Marvel Ultimate Spider-man Mystery City, anda dan wira super akan berada di sebuah bandar misteri yang tidak terdapat dalam peta. Kemungkinan besar dia berada di alam sejajar. Spider-Man ingin memahami bagaimana dia diangkut di angkasa dan mengapa tepat di sini. Untuk bergerak di sekitar bandar. Anda perlu melompat dan mendarat tepat di jubin biru, jika tidak, wira mungkin cedera di Marvel Ultimate Spider-man Mystery City.