Tugas anda dalam permainan Mergetopia adalah untuk mengisi lokasi dunia bawah air. Untuk melakukan ini, anda akan menggunakan fungsi gabungan. Klik pada buih, bintang laut akan muncul daripada mereka. Menggabungkan dua bintang bersama-sama akan menghasilkan cangkerang, dan cangkerang bergabung akan menghasilkan ketam. Dengan cara ini anda akan mengisi biome secara beransur-ansur. Anda mendapat kuda laut, sotong dan pelbagai jenis ikan dari kecil hingga gergasi. Setiap makhluk yang dicipta membawa syiling, anda boleh membelanjakannya untuk membeli penduduk baru dan mengisi takungan dengan lebih cepat di Mergetopia.