Wira anda di Ninja Assassin adalah seorang pembunuh Ninja dan dia akan melakukan tugasnya dengan bantuan anda. Ia terdiri daripada kemusnahan mereka yang kini menjadi musuhnya. Malah, tugasnya adalah untuk membersihkan gudang. Serangan besar-besaran dijangka merompak. Pengawal berjalan di sekitar bilik dengan kotak, menerangi jalan mereka dengan tanglung. Sekiranya ninja berada di zon yang diterangi oleh tanglung, pengawal akan melihatnya dan menyerangnya. Anda harus dipilih dari sisi gelap dan menyerang dengan serta-merta. Seluruh prosesnya diam supaya pengawal lain tidak waspada terhadap pembunuh Ninja.
