Atas sebab tertentu, kebanyakan makhluk asing yang tiba di ruang permainan terlibat dalam penculikan haiwan domestik: biri-biri atau lembu. Permainan Paper UFO tidak terkecuali. Anda akan mengawal piring terbang untuk mengambil seekor lembu dan mengangkutnya ke portal khas yang akan menghantar haiwan itu ke planet lain. Apabila anda mengklik pada kapal asing, rasuk menegak akan muncul, diarahkan ke tanah. Jika seekor binatang masuk ke dalamnya, ia akan mula bangkit. Sementara itu, anda mula menggerakkan plat untuk menggerakkan lembu, melepasi semua halangan berbahaya dan sampai ke portal dalam UFO Kertas.
