Semasa menyiasat satu lagi kes, wira permainan Mystery Subway Escape 2, detektif Michael, menemui pintu masuk rahsia ke stesen kereta api bawah tanah yang ditinggalkan. Hanya sedikit orang yang tahu tentang mereka. Kami tidak bercakap tentang terowong teknikal, tetapi mengenai stesen yang pernah beroperasi, tetapi atas satu sebab atau yang lain ternyata ditutup dan tidak dituntut. Ada beberapa peralatan, barang dan barang yang tertinggal di situ tidak dibuang kerana mungkin masih berguna. Di sanalah wira kita akan mencari bukti, dan kemudian jalan keluar, kerana pintu tempat dia masuk telah dikunci oleh seseorang dalam Mystery Subway Escape 2. Rupa-rupanya mereka sedang memerhatikannya dan memutuskan untuk menyingkirkan detektif yang teliti itu.