Wira permainan A Hollow Heartbeat Escape berpeluang tertidur di atas katilnya yang selesa dan bangun di pondok lama yang berangin. Dia membuka matanya dan segera menyedari bahawa dia tiada di rumah. Bagaimana pergerakan mistik seperti itu berlaku masih belum diketahui, tetapi buat masa ini kita perlu keluar. Bahagian dalam pondok itu hampir kosong kecuali sebuah meja, sebuah katil dan beberapa rak. Di luar ambang pintu terbuka, wira mendapati pondok itu terletak di sebuah pulau dan ini memburukkan keadaannya. Tetapi tidak perlu putus asa. Kumpul semua yang boleh berguna dan cari penyelesaian kepada masalah dalam A Hollow Heartbeat Escape. Terdapat bunyi yang berterusan datang dari suatu tempat yang kedengaran seperti degupan jantung dan ia agak menakutkan.
