Pada permulaan permainan Battle Monsters anda akan menemui watak kecil yang sedang menunggu di garisan penamat untuk raksasa besar seperti Godzilla. Tidak ada gunanya melawan dia seadanya, gergasi itu akan menghancurkan wira anda dengan satu jari kelingking. Oleh itu, anda perlu mendapatkan kekuatan, bermutasi dan menjadi sekurang-kurangnya sebagai raksasa, atau lebih baik lagi, lebih besar. Untuk melakukan ini, anda perlu mengumpul unsur hijau dan dalam keadaan apa pun tidak mengambil kapsul putih dan merah. Elakkan halangan, dan jika mustahil untuk melakukan ini, maka pecahkannya. Di garisan penamat, klik pada wira anda supaya dia memalu raksasa itu sehingga ia terbang jauh ke hadapan. Dan anda akan bergerak ke tahap baharu dalam Battle Monsters.
