Mafia di Jepun dipanggil Yakuza dan merupakan organisasi jenayah yang sangat serius yang beroperasi di luar undang-undang mengikut peraturannya sendiri. Jika dia memerlukan sesuatu, dia mengambilnya, tanpa mengira kehidupan dan keperluan mereka yang menghalang mereka. Samurai vs Yakuza memperkenalkan anda kepada samurai yang ingin menyelamatkan kampungnya. Penyamun menyukainya kerana kuil kuno yang terletak di wilayahnya. Di kuil ini terdapat beberapa patung berharga, yang ingin dimiliki oleh ketua Yakuza. Wira kami menghalang seluruh tentera mafia dan, dengan bantuan anda, akan menangkis serangan perompak berjubah hitam dalam Samurai vs Yakuza.
