Seorang lelaki dengan kuasa besar Spider-Man pergi berkhidmat dalam perisikan asing dan menjadi ejen istimewa seperti James Bond. Tetapi dia tidak memerlukan senjata; dia menghadapi musuhnya. Apa yang melepaskan jaring dari busur dan menjerat musuh dengannya, melumpuhkannya sepenuhnya. Dalam Mutant Assassin 3D, anda akan membantu wira menyelesaikan misi dengan menghapuskan ejen musuh yang tidak diingini. Mekanisme pemusnahan adalah mudah: anda halakan bulatan hijau pada penjahat merah seterusnya dan lepaskan web. Ia membalut tubuh dan musuh dikalahkan. Dengan cara yang sama, anda perlu mengumpul timbunan wang, mereka mesti dikumpul untuk melengkapkan tahap dalam Mutant Assassin 3D.
