Wira permainan Ninja Assassin menuntut bahawa dia dipanggil ninja Assassin, walaupun dari segi penampilan dia mempunyai sedikit persamaan dengan seorang pembunuh yang kejam dan tanpa belas kasihan. Di samping itu, sepanjang permainan, dia tidak akan menyentuh sesiapa pun dengan jari. Tugasnya adalah untuk pergi melalui dan mengumpul semua bintang emas. Anda boleh membantu ninja jika anda log masuk ke dalam permainan. Bimbing dia di sepanjang jalan supaya dia mengelakkan timbunan batu, perangkap besar yang jelas untuk seekor beruang dan segala macam makhluk berbilang warna yang aneh. Sebarang perlanggaran dengan objek di atas, baik yang hidup dan tidak bernyawa, akan membawa kepada penamatan kempen ninja dalam Ninja Assassin.
