Seorang pejuang Contra dari unit elit khas akan menjadi wira permainan Metal Wings. Wira perlu menghadapi lawan yang luar biasa - ini adalah raksasa dengan saiz yang berbeza. Mereka kuat, tangkas, mempunyai kebolehan istimewa, tetapi ada senjata yang sesuai untuk semua orang dan ia tidak akan menyelamatkan sesiapa pun. Senjata boleh diperbaiki atau ditukar kepada yang paling sesuai dalam situasi tertentu ini. Askar itu mempunyai pengalaman tertentu, jika tidak tiada siapa yang akan membawanya ke skuad elit, tetapi dia mungkin tidak mencukupi, jadi bantuan anda sangat diperlukan. Musuh terlalu kuat, dan kerana mereka bukan manusia biasa, sukar untuk menentukan di mana titik lemahnya. Hanya dalam tiga pertempuran ini akan menjadi jelas dalam Metal Wings.