Permainan pelari sangat popular dan yang tidak pernah berlari di sepanjang jalan maya, lebuh raya dan laluan kereta api metro. Permainan Nano Ninjas menjemput anda untuk berlari bersama-sama dengan ninja kecil yang suka bermain. Dia memutuskan untuk pergi memburu harta karun dan juga menemui sebuah kuil purba di mana dia boleh mendapatkan sesuatu yang berharga. Tetapi akibatnya, dia bukan sahaja tidak menerima apa-apa, tetapi juga kehilangan nyawanya. Sebaik sahaja dia menjengukkan kepalanya ke dalam kuil, seekor harimau kumbang hitam besar melompat keluar menemuinya dengan niat untuk membaham tetamu yang tidak diundang itu. Sudah tiba masanya untuk ninja melarikan diri dan sudah tiba masanya untuk anda campur tangan dan membantunya mengatasi halangan agar tidak bertukar menjadi makan malam untuk binatang dalam Nano Ninjas.
