Peperangan telah bermula antara puak ninja yang menyokong pelbagai pihak dalam perjuangan antara kuasa Terang dan Gelap. Dalam permainan Legenda Ninja, anda akan membantu wira anda melawan ninja gelap yang menyerang biara, di mana mereka menyediakan pahlawan kuasa cahaya. Di hadapan anda pada skrin anda akan melihat watak anda bersenjatakan perisai dan lembing. Tombak musuh akan bergerak ke arahnya. Anda, mengawal wira anda, perlu mengira trajektori lontaran dan melontar lembing ke arah musuh. Jika matlamat anda tepat, maka lembing akan mengenai musuh dan memusnahkannya. Lembing juga akan dilemparkan kepada wira anda. Anda perlu menggunakan perisai anda untuk melawan mereka. Juga, wira anda boleh menggunakan pelbagai kebolehan ajaib untuk melindungi atau menyerang musuh.
