Bayangkan bandar anda diserang oleh makhluk asing yang cuba menangkap seramai mungkin orang sebagai banduan. Anda dalam permainan Hero Masters akan menjadi wira yang perlu melawan. Watak anda akan mempunyai 10 kuasa super, yang diambil daripada wira super yang paling terkenal. Semasa anda maju melalui tahap, anda akan dapat membangunkan mereka semua. Sebelum anda pada skrin akan muncul jalan di mana wira anda akan berada. Menggunakan kekunci kawalan anda akan membimbing tindakannya. Anda perlu bergerak ke hadapan dan mencari musuh. Sebaik sahaja anda melihat makhluk asing, serangnya menggunakan salah satu kebolehan anda. Memusnahkan musuh akan memberi anda mata. Selepas mengumpul sejumlah mata, anda boleh membelanjakannya untuk meningkatkan mana-mana kebolehan.
