Semasa mengembara galaksi, seorang angkasawan bernama Jack menemui planet yang dapat dihuni. Sesampai di pesawat ulang-alik, dia memutuskan untuk turun ke permukaan planet dan menerokainya. Tetapi masalahnya adalah, ternyata, ada raksasa di dunia ini yang menyerang kapal watak kita. Dalam permainan Magnecyte, anda akan membantu wira anda melarikan diri dari pengejaran raksasa. Kapal anda akan terlihat di layar di depan anda, yang secara beransur-ansur mendapat kelajuan akan terbang di atas tanah. Monster akan mengejarnya. Dengan bantuan kekunci kawalan, anda akan memaksa kapal anda melakukan pelbagai manuver dan dengan itu bukan sahaja mengelakkan perlanggaran dengan pelbagai halangan, tetapi juga melarikan diri dari pengejaran monster.