Perang meletus di kerajaan laut antara dua orang yang berpura-pura takhta. Dalam masa permusuhan, kedua-dua pihak menggunakan detasemen ikan tempur yang dilatih khas. Dalam permainan BattleFish, anda akan menyertai salah satu pesta dan akan memerintah salah satu pasukan ikan. Lokasi tertentu yang terletak di bawah air akan kelihatan di skrin di hadapan anda. Di satu sisi akan ada ikan tempur anda, dan di sisi musuh yang lain. Di bahagian bawah akan ada panel kawalan khas dengan ikon. Dengan bantuan mereka, anda akan mengarahkan tindakan pasukan anda. Anda perlu memeriksa ikan musuh dengan teliti dan memilih sasaran anda untuk menyerangnya. Ikan anda akan bersama-sama menyerang dan memusnahkan musuh. Untuk ini, anda akan mendapat mata.
