Dalam permainan Kingdom of Ninja anda akan pergi ke kerajaan tempat pahlawan ninja tinggal. Dalam beberapa tahun kebelakangan ini terdapat keadaan cuaca buruk dan hasil tanaman sangat sedikit, dan raksasa yang dahagakan darah juga mula muncul. Raja sendiri memutuskan untuk membetulkan keadaan, kerana dia bertanggungjawab untuk kehidupan penduduknya. Untuk melakukan ini, dia perlu turun ke katakombe di bawah bandar, kerana dari situlah makhluk kegelapan mula keluar pada waktu malam. Di samping itu, dia membaca dalam skrol kuno bahawa khazanah purba tersembunyi di dalam labirin ini, dan jika semuanya dikumpulkan, mantra jahat itu akan dilenyapkan. Anda akan menemani wira anda, yang kelihatan seperti segi empat sama hitam dengan jalur merah di matanya. Untuk memenuhi semua syarat dari kronik kuno, dia perlu pergi ke bawah tanah tanpa bersenjata dan hanya ketangkasan yang luar biasa akan membantunya dalam melepasi semua ujian. Dari langkah pertama dia perlu menghadapi pelbagai perangkap, lubang di tanah dan tebing tinggi. Di sesetengah tempat anda perlu memanjat dinding untuk ke tingkat seterusnya. Jika anda bertemu raksasa di sepanjang jalan, maka anda tidak sepatutnya cuba menyerang mereka, kerana tidak ada peluang untuk memenangi pertempuran. Lebih baik lompat sahaja dan teruskan mencari peti harta karun di Kingdom of Ninja.
