Pada masa depan dunia kita yang jauh, umat manusia mulai menjelajahi kedalaman Galaxy dengan kecepatan yang dipercepat. Kapal angkasa terbang ke semua arah untuk mencari planet yang sesuai untuk kehidupan. Apabila planet seperti itu dijumpai di orbit, sebuah pangkalan ruang dibina. Ia dikunjungi oleh kapal penyelidik atau digunakan sebagai pos pementasan. Dalam permainan Math Controller anda akan memerintahkan pangkalan tersebut. Tugas anda adalah menangani navigasi. Pangkalan anda akan kelihatan di layar di depan anda, melambung tinggi. Kapal angkasa akan terbang ke arahnya dengan kelajuan yang berbeza. Tugas anda adalah meletakkan jalan untuk mereka. Ingat bahawa mereka tidak boleh bertembung antara satu sama lain. Apabila semua kapal mendarat di stesen, anda akan mendapat mata dan pergi ke peringkat permainan seterusnya.