Langkah kembali ke makmal untuk pengeluaran mutagen, yang membina Shredder jahat. Ini mutan makmal-dicipta, ia dijaga oleh beberapa robot, memusnahkan semua yang menghadap kepada mutagen. Ambillah salah seorang wira dan masuk ke dalam dan cuba untuk mengumpul semua bahan yang hanya akan mencari. Berjalan melalui koridor panjang dan bilik yang luas, mengelakkan tembakan dan mengumpul pizza untuk menambah kesihatan. Mencari bahan dan menjejaki masa yang mana anda perlu untuk memenuhi misi.
