Nampaknya tiada perkara seperti graviti untuk ninja dalam Flip Ninja. Dia boleh melompat ke atas dan kemudian jatuh ke bawah dengan ketangkasan yang sama, sentiasa berdiri teguh pada kedua-dua kaki. Oleh itu, melompat sendiri tidak menjadi masalah baginya, tetapi apa yang ada di angkasa akan menjadi ujian. Shuriken tajam dan objek menindik dan memotong lain terbang keluar dari kiri dan kanan. Anda perlu memilih masa apabila laluan itu jelas dan kemudian melompat. Untuk setiap lompatan yang berjaya anda akan mendapat satu mata, dan jika anda berjaya meraih buah: merah atau hijau, anda akan mendapat tiga mata sekaligus dalam Flip Ninja.