Mengembara ke seluruh dunia, Naruto secara tidak sengaja terjatuh ke dalam portal yang membawanya ke dunia bayangan. Sekarang wira kita perlu mencari jalan pulang. Anda dalam permainan Naruto Shadow Adventures akan membantunya dengan ini. Menggunakan kekunci kawalan, anda akan memaksa wira untuk bergerak ke hadapan melalui kawasan tersebut. Dalam perjalanan, dia akan mengatasi pelbagai halangan dan perangkap. Di mana-mana akan bertaburan syiling dan barangan lain yang wira anda perlu kumpulkan. Jika anda terserempak dengan penduduk dunia ini, shadow stickmen, anda perlu melawan mereka. Dengan mengawal tindakan Naruto, anda akan menyerang musuh. Dengan memusnahkan musuh anda akan menerima mata dan mengambil trofi yang akan jatuh daripadanya.