Thomas the Tank Engine dan rakan-rakannya memutuskan untuk menguji ingatan mereka. Anda dalam permainan Thomas and Friends Mix Up akan menyertai mereka dalam keseronokan ini. Di hadapan anda pada skrin, anda akan melihat padang permainan di mana kad akan diletakkan menghadap ke bawah. Dalam satu langkah, anda boleh membelek mana-mana dua kad dan melihat imej padanya. Selepas itu, mereka akan kembali ke keadaan asal dan anda akan bergerak semula. Tugas anda adalah untuk mencari dua imej yang sama pada kad dan membukanya pada masa yang sama. Oleh itu, anda akan mengeluarkan kad di mana ia digambarkan dari padang permainan dan anda akan diberikan mata untuk ini dalam permainan Thomas and Friends Mix Up. Apabila anda mengosongkan sepenuhnya bidang kad, anda boleh meneruskan ke peringkat seterusnya permainan.